1、晶泰科技的“药物固相筛选与设计平台”借助高性能计算资源和自己独有的计算模型帮助制药企业和新药研发团队快速地完成对药物固相的研发,既能大幅度缩短药物发展的时间,又能避免遗漏某些重要的药物固相,从而提高研发成功率, 降低研发成本与专利风险。
2、与云计算相比,采用超算平台存在的主要问题包括以下方面:首先是难以进行定制和部署对外服务;其二是计算资源的申请流程较为繁琐;其三是用户体验方面,超算中心通常都有大量任务排队,等候时间较长。晶泰科技的智能算法有很高的并行度, 这意味着时间和计算资源成反比,并且计算一般是按需和突发式的,不需要一直维持大量的计算节点。有些测试任务需要在几天内得到结果,这就需要同时调用数千个计算核心。
晶泰科技在选择云平台时首先考虑的是云主机的性能,其次是价格。药物晶体结构预测是计算密集型应用,计算量很大,对单节点机器的性能要求较高, 很多计算需要24个核心以上的主机。通过调研发现,晶泰科技发现目前只有Amazon EC2中的c3和c4型主机可以满足要求,更令晶泰科技惊喜的是艾卓迪诺提供供的AWS竞价实例的价格便宜。 此外,艾卓迪诺完善的服务、高稳定性和高安全性都是晶泰科技非常认可的。艾卓迪诺帮助晶泰科技逐步将药物固相预测平台迁移到AWS云平台上。
双方的技术团队首先对Amazon EC2的C4.8xlarge(采用Intel 至强E5-2680V2处理器)进行了性能测试,以保证能够高效地运行计算化学软件。 目前晶泰科技的“药物固相筛选与设计平台”已经全部构建在AWS云平台之上, 所使用的AWS云服务包括Amazon EC2、Amazon DynamoDB、Amazon S3、Amazon VPC等。
在这一架构中,Amazon EC2的计算优化实例作为主要计算资源,完成药物固相预测的相关计算任务;Amazon S3存储计算中间数据,按照使用量付费,无需关心容量; Amazon DynamoDB则用于存储业务数据;Amazon VPC用于分割不同的区域,保证整个系统的安全性。
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